我院儿科呼吸、感染、保健、心血管及免疫、肾脏、消化、新生儿、血液遗传与内分泌、儿童重症及神经等各亚专业设置齐全。其中儿童血液遗传专业是中国儿童肿瘤治疗协作组湖北地区牵头单位，已开展造血干细胞移植等技术；在国内率先创办爱心病房学校,并于2017年12月12日成功接受了李克强总理的视察。2018年9月儿童血液病房荣获第17届亚洲医院管理奖客户服务项目金奖。新生儿专业设重症监护病房、母婴同室病房及实验室，其重症抢救室为亚洲急救中心亚单位。儿内科心血管、感染、消化、呼吸及肾脏专业收治并成功救治各种心肌炎、先天性心脏病、呼吸道感染、胃肠道疾病、哮喘及哮喘持续状态、肾炎、肾病、遗尿症等患儿。内分泌专业是原湖北省儿科学会遗传-代谢-内分泌学组的组长单位，开展身材矮小性疾病、甲亢、甲减、肥胖症、糖尿病等各种代谢及内分泌疾病的诊治。儿童营养、保健专业是湖北省预防医学会常务理事单位，开展儿童喂养、体格发育评价及各种健康和营养咨询。儿童重症专业在武汉市综合医院中最早设立病房，可常规开展有创/无创呼吸机辅助呼吸、纤支镜诊疗技术、连续血液净化技术、镇静镇痛、危重症营养支持、中心静脉置管等各种相关诊疗技术。